济南综合保税区于2012年5月15日经国务院批准设立，2013年12月25日封关验收2.02平方公里。2017年5月，为充分发挥综合保税区与空港的叠加优势，打造对外开放新高地，济南启动将综合保税区整体迁建至济南遥墙国际机场北侧的工作。2018年12月5日，规划调整顺利获得国务院批复，面积3.18平方公里；2019年7月15日，顺利通过八部委封关验收。
济南综合保税区具有“保税加工、保税物流、国际贸易、口岸通关”四大功能，是济南和山东中西部地区唯一的海关特殊监管区域，是地区扩大对外开放、发展开放型经济的重要平台，也是对接融入“一带一路”国家发展战略的崭新窗口，在全市对外开放中优势独特，地位重要，搭建起济南和山东中西部地区与世界连通的快捷通道。
济南综合保税区新址位于济南新旧动能转换先行区、济南国际内陆港核心区、济南航空一类口岸叠加区域，区位优势明显。正式运行后，济南综合保税区将发挥遥墙国际机场、高铁济南新东站、欧亚班列董家货运枢纽、小清河航运济南港、城市轨道交通以及高速公路立体交通的叠加效应，极大拓展发展空间。
在今后的发展中，济南综合保税区将全面贯彻落实《国务院关于促进综合保税区高水平开放高质量发展的若干意见》，结合自身特点，加快各项政策落地实施。发挥国家新旧动能转换综合试验区、国家构建开放型经济新体制综合试点试验地区、山东半岛高新区国家自主创新示范区的叠加优势，坚持开放引领、创新驱动、集聚发展，构建现代物流与仓储、飞机维修与改装、保税加工与制造、跨境电商与商贸、金融与航空租赁五大特色产业体系，促进大数据与新一代信息技术、智能制造与高端装备、生物医药等领域加工贸易、保税物流业务集聚，打造全产业链集群，将济南综合保税区建设成为省会城市群进出口快捷通道、多式联运国际物流枢纽和开放型经济集聚区。
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